Математическое моделирование в последние десятилетия стало действенным инструментом исследования механизмов регуляции биологических процессов. Классические модели, основанные на системах дифференциальных уравнений малой размерности, позволяют описывать качественные свойства динамики систем: колебания, динамический хаос, автоволновые пространственные процессы. Классическим примером является модель гликолиза. Современные компьютерные технологии дают возможность формализации в виде модели знаний о структуре биомакромолекул, геометрии субклеточного пространства и элементарных законах взаимодействия биологических макромолекул. В докладе будут обсуждены кинетические и прямые многочастичные модели первичных процессов фотосинтеза и перспективы развития математического и компьютерного моделирования биологических процессов.